阳离子色谱柱采用制器（目前大部分离子色谱采用双柱型）抑制器产生死体积会使色谱峰扩散，这对弱保留离子特小明显。离子色谱柱一般采用聚合物柱与无机填料相化，聚合物柱刚生比较差，易收缩，因此同样的大小填料，聚合柱往往柱压比较高。
阳离子色谱柱的操作注意事项：
1、以外情况处理：仪器工作中遇到突然停电时，应该立即关闭离子色请仪主机电源开关，然后关闭计算机、显示器和打印机电源。
2、维护和保养：保持泵头无气泡，每周至少开一次机，若长时间未开机，请在开泵之前排除泵头气泡（先逆时针旋松泵头废液阓排气泡，观察管路，无气泡后拧紧泵头废液，但不要过紧）。
3、系统更换
将原系统卸下后，原来接柱的地方用黑色两通接头链接，将淋洗液瓶盖管路放离子水的容器中洗，用P试纸检测流出的废液至中性，关泵再将淋泆液瓶盖管路放入所要更换的淋洗液瓶中，开泵冲洗，用PH试纸测流出的废液至该淋洗液的酸碱性，后关泵，卸去刚才所接的两通管，将所需要更换的系统按其指示标签及管。
4、样品处理
含有强氧化性物质、油性水不溶物、高浓度有机溶剂等的样品不宜进样分析，尽量避免样品中的水不溶物进入柱子导致柱头堵塞或柱效能下降，应使用滤膜除去杂质，再使用C28须处理小柱除去有机物，以延长柱子的使用寿命。
